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免疫学是生物醫學的一個主要大分支，其探討的是在各器官中所產生的免疫反應。主要討論在健康或是生病時免疫系統所扮演的生理功能角色;一些免疫系統病變所產生的疾病(像是自體免疫反應、過敏反應或是免疫功能失調);以及在體內(in vivo)或是體外(in vitro)免疫系統構成分子的物理、化學或是生理性質。免疫學也已被廣泛應用在一些如以下所要探討領域上。

免疫系統的組織學
古典免疫學主要以傳染病學醫學為主。而研究身體系統和病原體間的免疫學。最早可以追溯到西元前430年古代雅典的一場傳染疾病。古代希臘歷史學家多笛特斯(Thucydides)記載，人們在疾病復原以後，可以免於第二次疾病帶來的侵害。許多古時候社會均循這個現象，但直到十九、二十世紀前，仍未發展成一套科學理論。 研究免疫學分子及細胞等成份之功能

古典免疫學
臨床免疫學主要研究免疫系統造成的疾病，或是其他醫療導致的免疫系統產生病變。大多數的發生的免疫疾病主要可以分成兩大項。一是免疫系統防衛上的缺陷，在這部分發生缺損，將無法產生適應免疫反應上的疾病（如慢性肉芽腫 chronic granulomatous disease）和自體免疫反應（autoimmunity），也就是免疫系統攻擊自己的抗原（比方說紅斑性狼瘡systemic lupus erythematosus、關節炎rheumatoid arthritis或重症性無力症 myasthenia gravis等疾病）。另一個則是因為其他免疫系統發生病變，包括引起各式的過敏反應，例如對於無害分子化合物的產生反應（如氣喘asthma、過敏allergies）或是反應過渡激烈。
艾滋病(AIDS)即是著名的免疫系統疾病，其由HIV病毒所引起。目前瞭解，愛滋病導因於因HIV病毒感染後，失去 CD4+（CD4陽性）T細胞（輔助T細胞)及巨噬細胞。
臨床免疫學也研究許多方法，來避免許多器官組織移植上所引起的過渡激烈免疫反應。如：避免同種移植allograft或是異種移植xenograft後被免疫系統所排斥、破壞。

臨床免疫學
利用免疫系統成分來治療疾病,也就是所謂的免疫療法.在癌症的治療上,常伴隨著化療chemotherapy或是放射線治療adiotherapy。然而，通常免疫療法被用來作為像是愛滋病患或是其他免疫缺陷疾病或是自體免疫病症病人之免疫抑制。

免疫療法
抗體和抗原的結合所形成的特殊鍵結，為診斷科學上的相當有利的工具。而在抗體上可以標記放射線物質、可以呈色的酵素、以及螢光物質等。便可以當作探針來標記抗原所在。
常用的技術像是免疫墨點法，ELISA，或是於切片上做免疫組織染色等。而現今，一些抗體常被製作出快速準確且簡單的檢驗試劑，用以檢測疾病，或是特殊物質等。

診斷免疫學
以研究現存生物物種之免疫系統為主，使我們可以利用免疫系統上的差異來了解物種的演化以及物種間免疫系統上的差異。以演化角度來看，免疫系統的複雜度，可以由簡單的微生物的胞飲作用，或是昆蟲體內的抗菌蛋白質，到脊椎動物的淋巴系統。另外像是昆蟲或是其他節肢動物並沒有適應免疫系統，僅有先天免疫系統。附帶一提，適應免疫系統也只有脊椎動物才具有。

演化免疫學
Goldsby RA, Kindt TK, Osborne BA and Kuby J (2003) Immunology, 5th Edition, W.H. Freeman and Company, New York, New York, ISBN 0-7167-4947-5